ภายใต้บันทึกความเข้าใจไทย-มาเลเซีย ฉบับ พ.ศ. 2522 นี้ ทั้งสองประเทศ ตกลงจัดตั้งองค์กรร่วมไทย-มาเลเซีย (Malaysia-Thailand Joint Authority: MTJA) ขึ้นมาเพื่อสวมสิทธิและความรับผิดชอบแทนรัฐบาลของสองประเทศในการสำรวจและแสวงประโยชน์จากทรัพยากรธรรมชาติในพื้นดินใต้ทะเลและใต้ดินที่ไม่มีชีวิตในบริเวณพื้นที่พัฒนาร่วมนี้เป็นเวลา 50 ปี ทั้งนี้ มีข้อกำหนดที่ทั้งสองประเทศจะต้องปฏิบัติดังต่อไปนี้

1. รัฐบาลทั้งสองประเทศจะร่วมรับผิดชอบค่าใช้จ่ายทั้งปวงที่เกิดขึ้น และผลประโยชน์ที่องค์กรร่วมฯ ได้รับจากกิจกรรมที่ดำเนินไปในพื้นที่พัฒนาร่วมจะแบ่งปันโดยเท่าเทียมกัน
2. เพื่อประโยชน์ในการใช้เขตอำนาจศาลทางอาญาของแต่ละประเทศ ให้ประเทศไทยมีเขตอำนาจศาลในพื้นที่ครึ่งบนของพื้นที่พัฒนาร่วม และให้ประเทศมาเลเซียมีเขตอำนาจศาลทางอาญาในพื้นที่ครึ่งล่างของพื้นที่พัฒนาร่วม แต่การใช้อำนาจศาลทางอาญาดังกล่าวจะได้กระทบกระเทือนต่อสิทธิและอธิปไตยของแต่ละฝ่ายในพื้นที่พัฒนาร่วม
3. ถ้าภายใน 50 ปี ทั้งสองฝ่ายสามารถหาข้อยุติอันเป็นที่พอใจสำหรับเส้นแบ่งเขตไหล่ทวีปได้ ก็ให้เลิกองค์กรร่วมนี้ แต่ถ้าไม่สามารถหาข้อยุติได้ก็ให้ใช้บันทึกความเข้าใจฯ นี้ต่อไป
4. รัฐบาลทั้งสองมีพันธะที่จะต้องคำนึงถึงสิทธิเดิมของผู้ที่ได้รับสัมปทานปิโตรเลียมจากรัฐบาลแต่ละฝ่ายอยู่ก่อนที่จะมีบันทึกความเข้าใจฯ ฉบับนี้ด้วย